标题：关于工龄认定的问题

我个人的情况是05年-08年在学校是一名在编教师，08年考取xx研究所全日制研究生，学习期间档案关系均在该研究所，11年研究生毕业后，留在该研究所工作至今。该研究所认定我之前学校工作的工龄以及硕士研究生学习期间的工龄不予计算。这个工龄认定影响到我工资、评职称、休假以及未来退休保障的一系列问题。

教高字〔1990〕001号文件第二条规定“在职人员考取国内硕士生，学习期间计算工龄”，我想请问一下：

（1）文件中的在职期间考取硕士生并没有说这个硕士生是在职硕士，还是全日制硕士，所以硕士期间不计算工龄合理么？

（2）我在学校期间工作的工龄不计算在内合理么？

（3）研究所这个工作单位是否能不执行这个教高字〔1990〕001号文件？